民國九十二年(2003年)十月二十五日, 老和尚以八十二歲高齡,再度閉法界關,精進修行,將功德回向道場重建圓成。更在關中積極編定靈巖規約,以古吳靈巖為藍本,並參照大陸金山、高旻規約,揉合成一套更為完備、且適用于現前臺灣靈巖山寺的規制。在法脈傳承上,確立本寺為「十方子孫叢林淨土道場」;為靈巖山寺制定了完整、健全的選賢制度。
民國九十七年(農曆)五月二十二日, 老和尚身無病苦,安詳示寂。世壽八十八歲,戒臘六十八歲。
老和尚臨終前道:「我自己念佛,自己去西方;去到西方,決定上品上生,不是還等你們來助念了才去。我隨去隨來,都沒有離開你們。」